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1、應(yīng)考慮和周圍環(huán)境的關(guān)系；一、二級生物安全實驗室無需特殊選址，可共用普通建筑物，宜在建筑物一段或一側(cè)。可與其它部分相通，但應(yīng)以可控制進入的密封門分開，有防止昆蟲和嚙齒類動物入內(nèi)的設(shè)置（微生物與化學(xué)分離）；應(yīng)參照《生物安全通用要求》執(zhí)行。
2、應(yīng)考慮所開展檢測項目的技術(shù)要求。開展致病菌檢測，應(yīng)配備生物安全柜 3、不同區(qū)域有效隔離(致病菌檢測)，防止交叉污染，一般分為下列區(qū)域：接樣室、樣品保存室、培養(yǎng)基配制室、無菌室、培養(yǎng)室、儀器室、鑒定室、洗刷消毒室(各區(qū)域應(yīng)配備紫外消毒等空氣消毒裝置)，此外，還應(yīng)有數(shù)據(jù)處理和資料保存室，辦公室。盡量減少往返和迂回；洗刷消毒室應(yīng)遠離實驗操作區(qū)。
4、設(shè)計時應(yīng)考慮水、電、通風(fēng)條件。 
5、實驗操作區(qū)域光線應(yīng)達到一定照度，540lx。但不應(yīng)在陽光直射下操作。貯存樣品和試劑的區(qū)域也應(yīng)避免陽光照射。